Quelle place pour l’anthropologie en temps de crise sanitaire ? Cet article propose d’aborder cette question en retraçant la naissance et le développement de SociocoViD, un projet d’anthropologie médicale développé dans le cadre d’une collaboration interdisciplinaire avec une équipe d’épidémiologistes et de médecins spécialisés en médecine sociale, dans le Canton de Vaud en Suisse. L’objectif de cet article est de mettre en lumière les différents enjeux méthodologiques, épistémiques et institutionnels que la mise en place du projet a soulevés en documentant les pratiques de l’interdisciplinarité « en train de se faire ».